En metod att identifiera plasmaproteiner hos barn som följts från födseln med många blodprov under flera år i TEDDY-studien.
Människans plasma består av tusentals olika proteiner. Många av dem bildas i levern men blodcellerna bidrar också. En av forskargrupperna knutna till TEDDY-studien har under flera år utarbetat en metod att identifiera och bestämma nivån av olika plasmaproteiner.
Avsikten med studien var att undersöka 6,426 plasma prover från 900 TEDDY-barn. En del av dem hade lämnat ett blodprov 29 gånger under sin uppväxt. Proverna analyserades med hjälp av masspektrometri och innefattade 916 kvalitetskontrollprover.
Resultaten visade att:
- 694 peptider kunde användas att identifiera 167 olika plasmaprotein hos var och en av de 900 TEDDY-barnen
- variationen mellan kvalitetskontrollproverna var låg, under 5%
- metoden kan användas i fortsatta analyser inte bara av TEDDY-prover men också av prover från andra studier
- metoden kan användas till att jämföra de många olika metoder som används för att identifiera plasmaproteiner.
Sammanfattningsvis konstateras att metoden är den första och hittills den största i världen att på ett säkert och kontrollerat sätt identifiera plasmaproteiner. TEDDY-barnen har återigen lämnat ett bestående bidrag till forskningen. Det långsiktiga målet är att använda metoden för att identifiera vilka av de 167 proteinerna som medverkar till de autoantikroppar som utvecklas först och till autoimmun typ 1-diabetes.
Författare: Lisa M.Bramer, Ernesto S. Nakayasu, Javier E. Flores, Jennifer E. Van Eyk, Michael J. MacCoss ,Hemang M. Parikh, Thomas O, Metz & Bobbie-Jo M. Webb-Robertson
Titel: Data from a multi-yeartargeted proteomics study of a longitudinal birth cohort oftype 1 diabetes.
Publicerad i Nature
TEDDY publikation nummer 171, 2025 (PDF, 1,24 MB, nytt fönster)